影片开始了，一大群企鹅拍着一个很长很长的队缓缓走来。企鹅三兄弟也在那个长长的队中。突然，他们看到一个蛋滚过来，由于很危险，所以一只企鹅都不敢去拣。企鹅三兄弟去捡的时候，被一个人推了下去，最终在一群恶兽口中逃脱了出来。这时，蛋壳破了，小企鹅走出来，被起名为菜鸟。

长大后，企鹅三兄弟要准备给老四菜鸟办一个生日宴会。三兄弟带着他闯进了美国国家金库，他们在那里吃着美食。吃着吃着，他们被一只因嫉妒别人比自己长的可爱，想把企鹅变成怪物的一只章鱼抓住了。最后，他们逃了出来，可是章鱼博士的手下仍对他们穷追不舍，最后他们被“北风特工组”救了。

“北风特工组”不想让企鹅们插手他们的任务，就把他们放到了一个安全的地方。在马达加斯加的飞机里。

企鹅们逃离了飞机，被转移到上海。到了章鱼执行计划的地方，最后企鹅四兄弟和章鱼斗智斗勇，战胜了章鱼，还救了“北风特工组”和企鹅们。

看完这部电影，马达加斯加企鹅的自信，自立 ，自强的精神，让我受益匪浅。