上古时期五谷和杂草长在一起，药物和百花开在一起，没人能分得清楚什么是粮食要什么是草药。百姓们只能靠打猎射杀为生，随着猎物越来越少百姓只能饿肚子，得病也无法医治。
       为此神农氏十分伤痛，他经常思考百姓以后怎么生存，生病了怎么治疗，他想了三天，第四天，他带着村民们从村庄来到大山上，山上开满了奇花异草，香气浓郁。突然遇到一波波狼虫虎豹，他虽然用神鞭把狼虫虎豹打退了，但是也受伤了，村民们劝他赶紧离开，但是神农氏坚持不肯离去。
       他站在一座小山上四处观望，看到了一群猴子爬古藤和朽木，神农氏灵机一动，让臣民开始做木架，过了360天，才达到了山顶。
      山顶上是一片花草世界，神农氏为了防止狼虫虎豹，让村民们在山上栽冷杉盖房屋，后来人们把这里叫做木城。白天他们尝百草，晚上他们照火做记录。
      有一天，他吃了一颗草中毒了，然后他吃了一颗红灵芝解毒了，从此人们就说，灵芝有起死回生的作用。
      他通过品尝分辨出了五谷和365种草药，写成了《神农本草》，他们正准备下山，发现木架已经长成了一片林海，无法下山，此时一群白鹤来到了山顶，把他们接到了天庭，后来那片林海就叫做神农架。